Zwischen 10% und 30% der Personen, die mit MPGN (membranoproliferativer Glomerulonephritis) diagnostiziert werden, haben in ihrem Plasma einen Autoantikörper gegen die C3-Konvertase. Der C3-Nephritisfaktor, ein Autoantikörper der IgG-Klasse, bindet an die C3-Konvertase des alternativen Aktivierungsweges und sorgt für deren Stabilisierung. Dieser Vorgang fördert die Aktivierung von C3, führt zur Anlagerung von C3 an Oberflächen und verursacht einen Verbrauch von C3. Typ II membranoproliferative Glomerulonephritis ist die Erkrankung, die typischerweise mit dem C3-Nephritisfaktor in Verbindung gebracht wird.